يتميز المبنى بتصميمه المعماري الرائع ويعلوه مئذنتان تم تشييدهما بشكل زخرفي رائع، تصاميم النوافذ تلفت نظر المصلين بشكلها المعماري المتميز، والنوافذ الصغيرة المحيطة بقبابه تشكل مصدر نور طبيعياً للمسجد، وفي الخارج تحفة معمارية بزخرفتها ودلالاتها لأنها تروي العطشى، ضمن مشروع سقيا الماء الوقفي.
