أعلنت لجنة المسابقات باتحاد كرة القدم القواعد والشروط والأحكام الخاصة ببطولة كأس رئيس الدولة موسم 2009-2010 وجاء في تعميم اللجنة للأندية ما يلي: اشتراك جميع أندية الدولة إجباري تطبيقاً للمادة رقم (14) من لائحة المسابقات، ويتم توزيع أندية الدولة على جدول المسابقة بطريقة القرعة بدءاً من الدور الـ 16، وتحتكم المباراة لوقت إضافي في حالة التعادل ثم تقام ضربات الجزاء الترجيحية في حالة استمرار التعادل، وتقام مباريات المسابقة على ملاعب محايدة.
تقام مباراتا الدور قبل النهائي والمباراة النهائية على استاد مدينة زايد الرياضية.
تم وضع النادي الأهلي بطل دوري اتصالات للمحترفين للموسم الرياضي 2008/2009 على رأس مجموعة، ونادي العين حامل لقب البطولة السابقة على رأس مجموعة ثانية.
تم تقسيم الأندية المحترفة طبقاً للترتيب النهائي لدوري اتصالات للمحترفين الموسم الماضي إضافة للفرق الصاعدة حديثا على النحو التالي: أندية المستوى الأول وعددها (6) أندية (الجزيرة، الوحدة، الشباب، الوصل، النصر، الظفرة)، على جدول المسابقة عن طريق إجراء القرعة على الأرقام التالية:
أندية المستوى الثاني وعددها (8) أندية (عجمان، الشارقة، بني ياس، الإمارات، العروبة، الشعب، اتحاد كلباء، الخليج)، كما قررت اللجنة إقامة دور ال16 يومي 23 و24 نوفمبر الجاري، ويقام دور ال8 يومي 25و26 ديسمبر المقبل، ونصف النهائي يومي 22و23 يناير من العام المقبل، على أن تقام المباراة النهائية يوم 19 أبريل من العام المقبل.
وقررت اللجنة المسابقات أنه في حالة وجود ناديي الوصل والشباب أو أحدهما في دور الـ 16 لمسابقة كأس صاحب السمو رئيس الدولة «حفظه الله »، تقام مباراتا الناديين أو أحدهما 24 نوفمبر بدلاً 23، وذلك لمشاركتهما في البطولة الخامسة والعشرين لأندية مجلس التعاون الخليجي لكرة القدم.
وأيضا أنه بدءاً من دور ال16 لمسابقة كأس صاحب السمو رئيس الدولة «حفظه الله» تسجيل عدد (3) لاعبين أجانب فقط من المقيدين بالفريق الأول للأندية المحترفة في تقرير المباراة واشتراكهم مع النادي في مباراته أمام أحد أندية الدرجة الأولى (أ)، أما بالنسبة للمباراة التي يكون طرفيها من الأندية المحترفة يتم تسجيل عدد(4) لاعبين أجانب في تقرير المباراة على ألا يشارك أكثر من(3) لاعبين داخل الملعب، وذلك لتحقيق مبدأ تكافؤ الفرص بين الأندية المشاركة في المسابقة.