اعتمدت لجنة المسابقات في اتحاد كرة القدم قواعد وشروط التصفيات التمهيدية لمسابقة كأس صاحب السمو رئيس الدولة (حفظه الله)، بين أندية الدوري الممتاز والدرجة الأولى، وأيضاً جداول مباريات المجموعات الأربع، وذلك بعد أن قامت اللجنة بإجراء القرعة بين الأندية، علماً بأنه سيتم تطبيق المادة رقم (23) من لائحة المسابقات بعد نهاية مباريات كل مجموعة لتحديد النادي الذي سيتأهل لدور ال16.
وشملت قواعد وشروط التصفيات التمهيدية للبطولة اشتراك جميع أندية الدولة بشكل إجباري تطبيقاً للمادة رقم (14) من لائحة المسابقات. وتم تقسيم أندية الدوري الممتاز والدرجة الأولى إلى أربع مجموعات، حيث تتكون المجموعات الثلاث الأولى من أربع أندية والمجموعة الرابعة من ثلاثة أندية. وتقام المسابقة بنظام الدوري من دورين.
وقامت لجنة المسابقات بإجراء القرعة بين الأندية بعد تقسيمها إلى أربع مستويات طبقاً للترتيب النهائي لدوري اتصالات لأندية الدرجة الأولى الموسم الرياضي 2008/2009، وانضمام ناديي الشعب والخليج من دوري اتصالات للمحترفين، وأيضاً تم إجراء القرعة بين أندية كل مجموعة من المجموعات الأربع.
وتبدأ المباريات يوم الخميس الموافق 27 أغسطس 2009، وتنتهي يوم الجمعة الموافق 9 أكتوبر 2009. ويتأهل النادي الذي أحرز المركز الزول في المجموعات الأربع (4 أندية) إلى دور ال16 لمسابقة كأس صاحب السمو رئيس الدولة (حفظه الله) لينضموا إلى أندية دوري اتصالات للمحترفين (12 نادياً).
والعقوبات التي لم يتم تنفيذها في الموسم الرياضي 2008/2009، والموقعة من قبل الاتحاد ورابطة الأندية المحترفة على أعضاء الجهازين الإداري والفني والأندية، سيتم تطبيقها بدءاً من هذه المسابقة في الموسم الرياضي 2009/2010.
والعقوبات التي لم يتم تنفيذها في الموسم الرياضي 2008/2009، والموقعة من قبل الاتحاد ورابطة الأندية المحترفة على اللاعبين سيتم تطبيقها بدءاً من هذه المسابقة في الموسم الرياضي 2009/2010، حتى في حالة انتقال اللاعب المعاقب إلى نادٍ آخر.
علماً أن المجموعة الأولى ضمت فرق: الرمس، العربي، دبي والعروبة، فيما تألفت المجموعة الثانية من فرق: الجزيرة الحمراء والشعب ودبا الحصن ومسافي. أما المجموعة الثالثة فتألفت من: الفجيرة، دبا الفجيرة، اتحاد كلباء ورأس الخيمة، أما المجموعة الرابعة فشملت فرق: حتا والذيد والخليج.