رحبت حركة الجهاد الإسلامي بإعلان حركتي «فتح» و«حماس» إنهاء خلافاتهما والتوقيع المبدئي على ورقة المصالحة بينهما. وأكد عضو المكتب السياسي لحركة الجهاد الإسلامي محمد الهندي على ضرورة اتفاق الفصائل الفلسطينية على مرجعية وطنية وفق برنامج سياسي يتفق عليها الجميع مباركا في الوقت ذاته الاتفاق بين حركتي فتح وحماس لإنهاء الانقسام. وقال إن حركة الجهاد لن تشارك في الحكومة المنوي تشكيلها وفقاً لما تم الإعلان عنه في القاهرة، مذكراً بموقف حركته المبدئي من مسألة المشاركة في أيٍ من مؤسسات السلطة التي تمخضت عن اتفاق أوسلو.