تنقل إلى الهيئة الاتحادية الجديدة للجمارك موظفو وأصول وموجودات وحقوق الهيئة الاتحادية للجمارك المنشأة بموجب القانون الاتحادي رقم 1 لسنة 2003. كما تنقل الى الهيئة المخصصات المقررة في الموازنة السنوية للهيئة الاتحادية للجمارك من تاريخ العمل بهذا القانون .
ويمنح موظفو الهيئة الذين يصدر بتحديد وظائفهم قرار من وزير العدل بالاتفاق مع رئيس الهيئة صفة الضبطية القضائية اللازمة لتنفيذ أحكام هذا القانون وتكون لهم جميع صلاحيات وواجبات مأموري الضبط القضائي وفق أحكام القانون .
ويخضع العاملون في الهيئة للائحة الموارد البشرية في الجهات الاتحادية المستقلة المعمول بها في الحكومة الاتحادية .ويلغي القانون الاتحادي رقم 1 لسنة 2003 بانشاء الهيئة الاتحادية للجمارك وتعديلاته كما يلغى كل نص يخالف أو يتعارض مع احكام هذا القانون. وينشر هذا القانون في الجريدة الرسمية ويعمل به بعد 6 أشهر من تاريخ نشره.