حصلت جمارك دبي في مايو 2009 على جائزة أفضل مزود للخدمات الإلكترونية عبر الإنترنت على مستوى الدوائر والمؤسسات والهيئات الحكومية وقطاع الأعمال في الشرق الأوسط، وذلك من قبل معهد جائزة الشرق الأوسط للتميز.

وتهدف جوائز المعهد التي تنظم سنويا إلى الإرتقاء بالخدمات ونشر ثقافة التعاملات الإلكترونية بالمنطقة، وتسليط الضوء على أبرز وأهم الإبداعات لتطبيقات حلول تكنولوجيا المعلومات التي تعتمدها المؤسسات الحكومية والخاصة من أجل تزويد المتعاملين بخدمات إلكترونية عالية الجودة.