أسست جمارك دبي إدارة حماية حقوق الملكية الفكرية، الإدارة الأولى من نوعها في الشرق الأوسط، وتضطلع الإدارة بتنفيذ للقوانين الاتحادية الخاصة بحماية حقوق الملكية الفكرية، وتؤدي دوراً رئيساً في حماية المداخل الرئيسية لإمارة دبي.
وبدأت الإدارة مباشرة عملها بصورة فعلية منذ 30 يونيو 2005 بقرار من المدير العام لجمارك دبي، واتخذت مبنى الجمارك موقعاً لها لمباشرة مهامها.
وتتكون الإدارة من ثلاثة أقسام رئيسة، وهي على النحو التالي: قسم قيد العلامات والوكالات التجارية الذي يتولى مهام تقييد العلامات والوكالات التجارية بعد تسجيلها لدى وزارة الاقتصاد للحماية الجمركية، والتواصل مع أصحاب العلامات والوكالات التجارية، وقسم متابعة القضايا، ومن مهامه متابعة قضايا التعدي على حقوق الملكية الفكرية مع المراكز الجمركية والمختبر الجنائي لشرطة دبي وأصحاب العلامات والوكالات التجارية، وقسم التوعية والتثقيف، ومن مهامه الرئيسة نشر مفهوم الملكية الفكرية على مستوى موظفي جمارك دبي، والمجتمع الخارجي من الدوائر الحكومية والمدارس والجامعات وغيرها.
ومنذ تأسيس الإدارة، اتخذت عبارة «معاً لأجل حماية أفضل» شعاراً لها، وشكلت فريق عمل موحداً في مجال الملكية الفكرية.