انضم المجلس الوطني الاتحادي إلى الاتحاد البرلماني العربي في العام 1975 وإلى الاتحاد البرلماني الدولي عام 1977، كما يشارك المجلس في مؤتمرات الحوار العربي الأفريقي والحوار العربي الأوروبي.
ويشارك المجلس الوطني الاتحادي في عضوية البرلمان العربي الانتقالي الذي تأسس عام 2005 لتعزيز التمثيل النيابي لشعوب الدول الأعضاء وتوسيع المشاركة السياسية في صنع القرارات الصادرة عن مجلس الجامعة العربية. كما أن المجلس الوطني الاتحادي عضو مؤسس في اتحاد مجالس الدول الأعضاء في منظمة المؤتمر الإسلامي، حيث شارك المجلس في اجتماع اللجنة التنسيقية بطهران عام 1998 الذي تم فيه صياغة مشروع النظام الأساسي للاتحاد والذي كان للمجلس دور مهم في إدخال بعض التعديلات عليه، وتولى المجلس الوطني الاتحادي رئاسة الاتحاد عام 2 010.