تبذل بلدية دبي جهودا مكثفة ومستمرة لحماية البيئة البحرية من خلال تنظيف الممرات المائية في خور دبي وميناء الحمرية من النفايات الطافية بشكل يومي بواسطة قوارب متخصصة, اضافة إلى رقابة المنشآت الساحلية ذات التأثير المباشر أو غير المباشر على البيئة البحرية . ولم تقتصر جهود البلدية على البيئة البحرية وإنما امتدت إلى جوانب أخرى حيث انشأت بالتعاون مع شرطة دبي محمية طبيعية لطيور الفلامنجو (مالك الحزين) . كما حددت البلدية المنطقة الممتدة من جبل علي إلى رأس غنتوت محمية للشعاب المرجانية.
